Z dôvodu nízkej obsadenosti nebudú vedené 4 osobné vlaky a 3 nové vlaky pribudnú. Zmení sa čas príchodov a odchodov niektorých vlakov do jednotlivých železničných staníc a zastávok.
Zmena názvov vlakov
IC 500 a IC 501 Kriváň sa budú volať IC 500 a IC 501 ZELMER
R 610 a R 611 Považan sa budú volať R 610 a R 611 PANASONIC
Zmeny v diaľkovej a medzištátnej doprave
Priamy ležadlový a lôžkový vozeň Košice – Praha hl. n. – Plzeň hl. n., ktorý je pravidelne zaradený v R 440 Exceslior, bude z Prahy hl. n. odchádzať v súprave R 350 Karel Čapek a do Plzne bude prichádzať o 6.50 h. Priame vozne na sedenie, ktoré jazdia na trase Košice – Praha hl. n. – Františkovy Lázně, pôjdu z Prahy hl. a budú jazdiť iba do Plzne s príchodom o 6.50 h.
Priame vozne na sedenie Františkovy Lázně – Praha hl. n. – Košice, radené v R 441 Excelsior, budú jazdiť z Plzne hl. n. v R 357 Franz Kafka so skorším odchodom z Plzne hl. n. o 21.08 h. Pokračovať budú v R 441 Excelsior s príchodom do Košíc o 10.07 h, rovnako ako aj priamy ležadlový a lôžkový vozeň.
Cez pohraničnú prechodovú stanicu Kittsee do Bruck a.d. Leitha, resp. Parndorfu pôjdu vlaky Regional Expres (REX) 7650, 7654, 7652, 7608, 7656 a 7653 v pracovných dňoch, nepôjdu však v pondelok 26. októbra, v utorok 8. decembra 2009 vo štvrtok 24. decembra a vo štvrtok 31. decembra.
Zmeny vo vnútroštátnej doprave
Región Západ
Bratislava – Kúty - Břeclav (trať č. 110)
- Osobný vlak (Os) 4684 (Kúty odchod o 17.11 h – Lanžhot príchod 17.21 h), bude jazdiť v pondelok až piatok a nepôjde 1. a 15. septembra a 17. novembra 2009.
Bratislava – Leopoldov (trať č. 120)
- Z Leopoldova do Nového Mesta nad Váhom bude jazdiť nový Os 3043. Z Leopoldova bude odchádzať o 8.24 h a a do Nového Mesta nad Váhom bude prichádzať o 9.14 h. Vlak bude jazdiť denne.
- Zrýchlený vlak (Zr) 1704 (Trnava odchod o 5.58 h – Bratislava hl. st. príchod o 6.32 h) bude jazdiť iba počas pracovných dní. V opačnom smere bude Zr 1705 (Bratislava hl. st. odchod o 17.20 – Trnava príchod 17.56 h) jazdiť tiež len počas pracovných dní.
- Z Trnavy (odchod o 15.13 h) do Leopoldova (príchod o15.31 h) a Nitry (príchod o 16.27 h) pôjde v pracovné dni nový Os 5113, a to od 1. júla do 31. augusta 2009.
- Os 3049 z Bratislavy hl. st. (odchod 16.55 h) do Leopoldova (príchod o 18.22 h) bude jazdiť v pracovných dňoch.
Región Sever
Trenčianska Teplá – Trenčianske Teplice (trať č. 122)
- Os 3409 z Trenčianskych Teplíc pôjde o 6 minút skôr (Trenčianske Teplice odchod o 11.11 h - Trenčianska Teplá príchod o 11.29 h).
Trenčín – Horné Srnie – Vlársky prúsmyk (trať č. 123)
- Os 3511 bude jazdiť z Vlárskeho prúsmyku o 10 minút skôr (Vlársky prúsmyk odchod o 11.09 h – Trenčín príchod o 11.42 h).
Žilina – Skalité - Zwardoň (trať č. 129)
- V tomto úseku zaviedla ZSSK od 2. septembra dva nové vlaky, a to Os 4142 (Skalité odchod o 7.15 h – Skalité Serafinov príchod o 7.26 h) a Os 4149 (Skalité Serafinov odchod o 7.36 h – Skalité príchod o 7.47 h). Vlaky budú jazdiť v pracovných dňoch.
Trenčín – Chynorany (trať č. 143)
- Dva osobné vlaky budú zastavovať aj v železničnej zastávke Soblahov. Os 5402 v smere do Chynorian o 5.55 h a Os 5409 v smere do Trenčína o 16.16 h
Kraľovany – Trstená (trať č. 181 )
- Os 7950 z Trstenej (odchod o 4.56 h) do Kraľovian (príchod o 6.41 h) bude jazdiť v pracovné dni a sobotu
- Os 7944 (odchod z Trstenej o 21.30 h) a Os 7952 (odchod z Trstenej o 5.16 h) budú zrušené
Región Stred
Jesenské – Rimavská Sobota (trať č. 174)
- Os 6715 pôjde z Rimavskej Soboty o 7 minút neskôr. (Rimavská Sobota odchod o 19.07 h – Jesenské príchod 19.25 h)
Región Východ
Dobšiná – Rožňava (trať č. 167)
- Os 6450 s odchodom z Rožňavy mesta o 5.04 h a Os 7001 s odchodom z Rožňavy o 4.53 h budú zrušené